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粪肥是复杂的有机物质，具有很高的生物耗氧量BOD，直接施入水体，其矿化分解过程中进行，耗氧量太大。根研究，将1吨粪完全矿化分解成无机盐需消耗3.5吨氧气，而1亩水面2米水深溶氧充足总的溶氧量不超过7公斤左右，足见粪肥分解过程对池塘溶氧的严重影响程度。除非您的水面足够大，足以利用水体的自我净化能力，来消耗它们，否则不要选择直接施粪肥的方法；
直接施到水体中的话，会大量和短时间内消耗局部水体大量的氧气，造成缺氧，再造成亚硝酸盐增加和脱氮损失，所以，动物粪便是在岸上采用发酵的方式进行预处理，经过发酵后，复杂的有机物质变成简单的有机物质，虽然施入水体中需要继续分解耗氧，但主要的耗氧过程中在预发酵处理中完成的，对水质的影响就小多了。
粪肥中往往有含多种致病菌，例如草食性动物牛、羊、兔粪中就含有大量的粘。通过发酵，可有效杀灭其中的病原体。
2. 发酵的方法
① 使用益富源粪便腐熟剂在粪池中厌氧发酵25天以上，1袋益富源粪便腐熟剂可发酵10立方。
② 或采用益富源粪便腐熟剂堆积发酵处理，采用一层秸秆料＋一层粪料＋一把发酵剂混合物的方法进行发酵，粪料与秸秆料比例为7比3左右，一包益富源粪便腐熟剂发酵5吨这样的有机物料，粪便腐熟剂先与5公斤的米糠或麦麸或玉米粉等预先混合制成发酵剂混合物，按以上方法撒入每一层料中去，每辅一层，需要加足水份，物料呈半固体状态，再简单覆盖塑料膜；发酵容器可以用窖池，土坑（内衬塑料膜防止水份流失）；发酵10天左右即可成熟，使用时，可用水浸泡后，取肥汁施于鱼塘中。剩下的渣子则可以作为农作物植物肥料使用。
所以在使用益富源粪便腐熟剂时，建议把窖池土坑建设在水库上游的岸边，方便洗肥水入库，或成阶梯状建在坡上，或随着涨水一个池一个池地淹入水中。
