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粪便是复杂的有机物质，具有很高的生物耗氧量BOD，直接施入水体，其矿化分解过程中进行，耗氧量太大。根研究，将1吨粪完全矿化分解成无机盐需消耗3.5吨氧气，而1亩水面2米水深溶氧充足总的溶氧量不超过7公斤左右，足见粪肥分解过程对池塘溶氧的严重影响程度。除非水面足够大，足以利用水体的自我净化能力来消耗它们，否则不要选择直接施粪肥的方法；粪便直接施到水体中的话，会大量和短时间内消耗局部水体大量的氧气，造成缺氧，再造成亚硝酸盐增加和脱氮损失，所以，动物粪便是在岸上采用发酵的方式进行预处理，经过发酵后，复杂的有机物质变成简单的有机物质，虽然施入水体中需要继续分解耗氧，但主要的耗氧过程中在预发酵处理中完成的，对水质的影响就小多了。粪肥中往往有含多种致病菌，例如草食性动物牛、羊、兔粪中就含有大量的粘。通过发酵，可有效杀灭其中的病原体。
发酵猪粪喂鱼可以采用厌氧发酵，也可以采用好养发酵，因为鱼属于冷血动物，一般只需要蛋白，不需要能量。
发酵方法：
1.1瓶益富源粪便发酵剂兑水40斤，将无霉变无病菌的禽畜粪便1800斤，玉米粉或麦麸、谷糠200混合均匀。
2.然后用喷雾器均匀的喷洒到混合料中，后调节含水量为50%左右。
3.再密封发酵；发酵容器可以用塑料袋、窖池，土坑（内衬塑料膜防止水份流失）；发酵7-10天左右即可成熟。
4.发酵粪便喂鱼一般作为肥水来用，比如猪粪作为鱼肥是可以的，但不可以用来直接喂鱼的，因为猪粪本身是没有什么营养价值的，但含氮磷比较多，是比较优质的鱼肥，但也必须发酵无害化处理后，才能作为鱼肥，通过培育水体中的优质藻类，来间接的喂鱼。
5.作为水肥来说，不需要充分的后熟发酵，不象发酵鸡粪来喂猪那样苛刻，所以，也可以在常规发酵条件下，发酵10天左右就可以用了。
使用方法：
1. 使用时，可用水浸泡后，取肥汁施于鱼塘中。剩下的渣子则可以作为农作物植物肥料使用。一般每亩10-20公斤左右用于肥水。视水质情况，调节使用量。
2. 发酵好的鸽粪鸡粪等蛋白较高的禽类粪便，可以直接喂鱼，也可以加入28%的糠麸、12%的花生饼做成团状喂鱼，每天上午8时，中午12时，下午5时各定点投喂一次，日投量为全池鱼体重的4%—6%。
3. 将经发酵后的猪粪作为基肥施入，每亩鱼塘可施150公斤左右；用作追肥时，每10天左右1次，每次每亩施50公斤左右。具体施入次数和数量，应根据水的颜色来决定，以鱼塘水质呈草绿色、茶褐色为佳，如水的颜色呈铁锈色时，应减少猪粪的施入量。同时，要搭配部分精饲料，促使鱼类快速生长。
